Avec 514 agents au service de tous les habitants de l'agglomération, la Communauté urbaine de Cherbourg est le 7e employeur de l'agglomération. L'instance vient de refondre sa structure interne. Désormais, l'effectif est réparti selon trois grands pôles : administration-ressources, opérations-services techniques, développement-solidarité.

Administration-ressources
Le pôle administration et ressources regroupe les services transversaux qui participent au fonctionnement de la structure : l'administration générale et les affaires juridiques (vie des assemblées, conseil juridique, gestion des dossiers concernant les biens et les personnes), les finances (comptabilité, budget), les ressources humaines (recrutement, formation, relations sociales), la communication et les relations publiques, les technologies de l'information et de la communication, les services généraux (appui logistique aux différents services).

Opérations-services techniques
Le pôle opérations et services techniques regroupe les services qui ont pour objectif de répondre aux besoins en termes d'aménagement du territoire et de services aux usagers : le cycle de l'eau (entretien des réseaux, exploitation, qualité des eaux), la voirie et les déplacements urbains (travaux d'aménagement, signalisation, plan de circulation), l'urbanisme et le foncier (plan d'occupation des sols, gestion foncière), les bâtiments (études et travaux, gestion du patrimoine), la mécanique (gestion du parc de véhicules et des approvisionnements), la propreté (collecte et traitement des ordures ménagères, nettoiement), le système d'information géographique (développement de l'outil et animation), la mission environnement (suivi des actions environnementales, communication).

Développement-solidarité
Le pôle développement et solidarité a vocation à travailler sur les enjeux stratégiques d'un développement local durable, le plus souvent définis avec des partenaires dans le cadre de politiques contractuelles. Il contribue à la définition d'un projet aux multiples facettes : les affaires économiques et l'enseignement supérieur (zones d'activité, pépinières et bâtiments d'accueil d'entreprises, transfert de technologie et confortement de l'enseignement supérieur, dossiers européens), le développement social urbain (politiques de l'habitat, service public du logement, politiques de solidarité avec le contrat urbain de cohésion sociale et la coordination des actions de prévention et de santé, observatoire), le renouvellement urbain (intégrant l'opération ANRU "Entre terre et mer").